Συγκλονιστική ήταν η παρουσία των αθλητών του Παναθηναϊκού στους Ολυμπιακούς αγώνες που έλαβαν χώρα στο Σίδνευ το 2000 και ο Σύλλογος δεν λησμονεί τη στιγμή.

Αναλυτικότερα οι «πράσινοι» και οι «πράσινες» είχαν τα εξής αποτελέσματα: Λεωνίδας Σαμπάνης άρση βαρών  62κ. 317,5κ. 2ος (νέο ολυμπιακό ρεκόρ) Κώστας Λούδης, Τεό Λοράντος, Φίλιππος Καϊάφας, Κώστας  Δάνδολος  10οι στο πόλο, Χρήστος Πολυχρονίου σφύρα 74,02 23ος, Παναγιώτης Στρουμπάκος 800 μ. 1.47.96 35ος,  Ζωή Δημοσχάκη 200 μ. ελεύθερο κολύμβηση  2.04.06 25η, Ζέλικο Ρέμπρατσα, Ντέγιαν  Μποντίρογκα  μπάσκετ Γιουγκοσλαβία 6οι,  Τζόνι Ρότζερς Ισπανία Μπάσκετ  9ος,  Ευρυπίδης  Δημοσθένους  Κύπρος  400 μ. 65ος, Κώστας Ποχάνης  Κύπρος  400μ. εμπ. 51.20 43ος ,Γιώργος Ανδρέου Κύπρος Δέκαθλο  29ος εγκατέλειψε και  Στάθης Στάσση Κύπρος 3000 στ. 40ος εγκατέλειψε.