Ο Παναθηναϊκός έχει αφήσει το δικό του αποτύπωμα στον ελληνικό αθλητισμό ακόμα και σε ομάδες που δεν έχουν τα χρώματα ή το σήμα του.
Η Πέρα Κλουμπ ιδρύθηκε από Έλληνες της Κωνσταντινούπολης το 1914. Οι ρίζες της ομάδας εντοπίζονται στο ιστορικό σωματείο «Ερμής Πέρα».
Την περίοδο της Μικρασιατικής Καταστροφής, η Πέρα Κλουμπ βρισκόταν σε τουρνουά στη Γαλλία. Οι ποδοσφαιριστές της φοβήθηκαν να επιστρέψουν, ζητώντας πολιτικό άσυλο στην Ελλάδα. Έτσι, βρέθηκαν πρόσφυγες στην περιοχή των Αμπελοκήπων.
Κάποιοι εξ αυτών των προσφύγων έγιναν μέλη του Παναθηνα ϊκού (όπως ο Κώστας Δημόπουλος), ενώ ορισμένοι άλλοι μετεγκαταστάθηκαν στη Θεσσαλονίκη και συνετέλεσαν στην ίδρυση του ΠΑΟΚ. Ωστόσο, οι περισσότεροι πρόσφυγες-πρώην αθλητές της Πέρα στελέχωσαν (διοικητικά και αγωνιστικά) τη νεοσύστατη ΑΕΚ, στην οποία μεταλαμπάδευσαν το σήμα και τα χρώματα που είχαν επί τουρκικού εδάφους.
Πάντως, για να δημιουργηθεί η ΑΕΚ, χρειάστηκε η αρωγή του Παναθηναϊκού. Με προσωπική πρωτοβουλία του Απόστολου Νικολαΐδη, της παραχωρήθηκε το γήπεδο της Λεωφόρου Αλεξάνδρας, τόσο για τις ανάγκες προπονήσεων όσο και για αγώνες. Όμως, αρκετοί από τους πρόσφυγες δεν θέλησαν να αποχωριστούν το όνομα του ιστορικού σωματείου και προτίμησαν να δημιουργήσουν το 1924 την Πέρα Κλουμπ Αθηνών, υπό την καθοδήγηση των Αντώνη Γρηγοριάδη και Καραγιαννίδη.
Η ομάδα στεγάστηκε στη γειτονιά των Αμπελοκήπων και διατηρούσε στενές σχέσεις με τον Παναθηναϊκό. Ο Τύπος την κατέγραφε κατά καιρούς και με την ανεπίσημη ονομασία «ΑΟ Αγίου Δημητρίου Αμπελοκήπων», που υποδηλώνει την περιοχή που στεγαζόταν. Από ’κει και πέρα, αρκετοί ποδοσφαιριστές της ομάδας, όπως ο Δημήτρης Σκορδάς, ήταν δηλωμένοι παναθηναϊκοί. Τέλος, να σημειωθεί πως η Πέρα Κλουμπ Κωνσταντινούπολης δεν διαλύθηκε.
Οι εναπομείναντες παίκτες και στελέχη συνέχισαν την αγωνιστική δράση του σωματείου και μετά τη Μικρασιατική Κα ταστροφή, όμως πλέον με την ονομασία «ΑΣ Πέρα» (ή στα τουρκικά με το όνομα «Μπέγιογλουσπόρ»). Από αυτόν τον σύλλογο, μάλιστα, ξεπήδησε ο σπουδαίος αρσιβαρίστας του Τριφυλλιού Χρήστος Ιακώβου. Το 1951, το σωματείο της Κωνσταντινούπολης έκανε ένα ιστορικό και συναισθηματικά φορτισμένο ταξίδι στα πάτρια εδάφη, για να αντιμετώπισει σε αγώνες μπάσκετ και ποδοσφαίρου τις μεγάλες αθηναϊκές ομάδες. Στις 16 Σεπτεμβρίου, χιλιάδες Έλληνες φίλαθλοι κατέκλυσαν τη Λεωφόρο για να χειροκροτήσουν τους ομογενείς. Η «Αθλητική Ηχώ» περιγράφει γλαφυρά: «Οι ποδοσφαιρισταί του Πέρα Κλουμπ εισέρχονται στο γήπεδο. Το θέαμα είναι πράγματι συγκινητικό. Οι ομογενείς της Κωνσταντινουπόλεως κατευθύνονται προς το κέντρον κρατώντας μια μεγάλη πράσινη σημαία, ενώ μια γλυκιά βροχή ενθουσιωδών χειροκροτημάτων τους ανταποδίδει τη φιλοφρόνησι».