Ο Παναθηναϊκός έχει αφήσει το δικό του αποτύπωμα στον ελληνικό αθλητισμό και διαχρονικά υπάρχουν σωματεία που φέρουν το όνομα του , το σήμα και τα χρώματα του, φτιαγμένες από «αιώνια πιστούς».
Μια παρέα φίλων του Τριφυλλιού από το Αγρίνιο ίδρυσε το 1982 τον Παναθηναϊκό Αγρινίου, ο οποίος αγωνιζόταν σε τοπικά πρωταθλήματα της Αιτωλοακαρνανίας
Το 2008, οι παίκτες της ομάδας ήρθαν σε επαφή με την ΠΑΕ Παναθηναϊκός και εξασφάλισαν την υποστήριξή της, με την αποστολή αθλητικού υλικού.
Το 2011, με αφορμή την επίσκεψη του επίσημου Παναθηναϊκού στην πόλη για παιχνίδι με τον Παναιτωλικό, τους δόθηκε μια πρώτη ευκαιρία να δουν από κοντά την ομάδα και παράλληλα, να τιμήσουν τον τότε αντιπρόεδρο της ΠΑΕ Βασίλη Κωνσταντίνου. Επίσης, βραβεύτηκε ο Χρήστος Κουτσοσπύρος, ο οποίος ξεκίνησε από την ομάδα του Παναθηναϊκού Αγρινίου και έπειτα έγινε παίκτης του Παναιτωλικού, καθώς και άλλων σωματείων της Α΄ Εθνικής.
Ορισμένοι από τους υπόλοιπους άσους της ομάδας ήταν οι Γκουρνέλος, Κορέτσης, Παπαθανάσης, Πριτσούλης και Καράτσαλος.
Τον Σεπτέμβριο του 2018 ο Παναθηναϊκός Αγρινίου συγχωνεύτηκε με τον ΑΟ Αγρινίου (σωματείο που είχε ως βασικά χρώματα το πράσινο και το πορτοκαλί). Διατηρήθηκε το πράσινο χρώμα, όμως επιλέχθηκε η ομάδα να συνεχίσει με την ονομασία του δεύτερου συλλόγου.
